Les partenaires co-financeurs des études de niveau avant-projet sommaire du projet de Branche Ouest de la LGV Rhin-Rhône sont les suivants :

l’Etat ;
la Région Alsace ;
la Région Bourgogne ;
la Région Franche-Comté ;
Réseau Ferré de France.

Ils se réunissent au sein du Comité de Pilotage sous l’égide du Préfet de Région Franche-Comté, coordonnateur du projet Rhin-Rhône, de manière à en suivre l’avancement global.

Le Comité de Pilotage, qui a une compétence d’ensemble pour les 3 branches du projet Rhin-Rhône, accueille également :

les régions Loraine et Rhône-Alpes
la SNCF ;
la Fédération Nationale des Usagers des Transports (FNAUT) ;
l’association Trans-Europe TGV Rhin-Rhône Méditerranée ;
la Suisse, Office Fédéral des Transports ;
un représentant de la Commission de Suivi du Débat Public.

Le pilotage du projet se partage entre un comité de pilotage commun à l’ensemble du projet Rhin-Rhône et un Comité Local de Suivi, plus spécifiquement en charge de la traversée de l’agglomération dijonnaise.