Au sein de Réseau Ferré de France, la Direction Régionale Bourgogne – Franche Comté pilote la maîtrise d’ouvrage de la LGV Rhin-Rhône.

Direction Régionale
- Directeur Régional : Abdelkrim Amoura

Service Communication
- Responsable Communication : Valérie Lépinay

Service Environnement
- Responsable Environnement : Anne Petit

Direction d\'Opérations de la LGV Rhin-Rhône Branche Est
- Directeur d\'Opérations : Xavier Gruz
- Adjoint au Directeur d’Opérations : Patrick Sabatier

Mission Branche Ouest / Branche Sud
- Chef de mission : Laurent Banlin

Service Projets d’Investissements 
- Responsable Service Projets d’investissements : Pascal Guillaume

Service Administratif et Financier 
- Chef du Département : René-Paul Simon

Département Aménagement du Patrimoine
- Responsable Aménagement du Patrimoine : Thomas Helbert

Service Commercial et Gestion du Réseau 
- Responsable Service Commercial et Gestion du Réseau : Antoine Latouche-Halle